El H. Ayuntamiento de Ecatepec, dentro del organigrama de la Dirección General de Desarrollo Urbano y Ecología tiene la Subdirección de Ecología que para el desarrollo de las acciones y gestiones de este ámbito, cuenta con 3 jefaturas: a) Normatividad e Impacto Ambiental, b) Estudios y Proyectos Ecológicos y c) Restauración y Preservación Ecológica y Educación Ambiental, con un total de 17 elementos; además se tiene constituido el Consejo Municipal de Protección al Ambiente y se cuenta con el grupo ecologista Ehécatl.
El H. Ayuntamiento cuenta con su propio Reglamento Municipal de Protección al Ambiente, instrumento legal que contempla los puntos de su competencia en campos como: formulación de la política ambiental municipal; desarrollo de instrumentos de gestión ambiental, ordenamiento ecológico del territorio municipal, sistema de áreas naturales protegidas en su territorio, evaluación del impacto urbano, el diagnóstico ambiental, el registro y control de descargas de aguas residuales, educación ambiental y el desarrollo científico y tecnológico, denuncia popular, manejo de residuos sólidos municipales, etc.
La Subdirección de Ecología realiza visitas de inspección y vigilancia dentro del contexto ambiental, atiende las denuncias ciudadanas en lo relativo a quejas ambientales, organiza campañas de limpieza, impartición de pláticas y conferencias y da seguimiento a las condicionantes ambientales emitidas por la Secretaría de Ecología del Gobierno del Estado de México en materia de impacto ambiental y a los proyectos de nueva creación o ampliación en el municipio.